无论办理普通港澳通行证券还是商务类签证，《港澳通行证》都是同一本的，只是贴在里面的签注页不同而已。如果你是外地户口，就建议你办理商务类签注。你是深圳户口，毫无疑问，肯定建议你办理个人签注了普通港澳通行证。因为深圳户口，也可以办理一年多次有效的普通港澳通行证。办理商务签注手续繁琐，而且需要的证明资料很多。同时，商务签注一般员工只能办理一次有效的签注。如果你非要问两类签注，有什么分别的话，那只能跟你说，商务签注手续繁琐，而普通港澳通行证就非常简便。其他都一样。普通港澳通行证就是为了方便一般市民而设置的。

那么港澳通行证和商务签证的区别在哪里呢：

1、概念不同

港澳通行证是大陆居民前往台湾地区定居、探亲或应邀参加经济、科技、文化、教育、学术等活动，向户口所在地的市、县公安机关出入境管理部门提出申请，凭公安出入境管理部门签发的；

而商务签证是去目的地国商务考察者办理商务签证后在该国只能作短期逗留，考察人员应该在签证固定的时间内离开该国家。

2、签发地不同

港澳通行证是由中华人民共和国公安部出入境管理局签发给中国内地居民因私往来香港或澳门地区旅游、探亲、从事商务、培训、就业、留学等非公务活动的旅行证件；

而商务签证是有关人员因公务或者个人原因去目的地国家从事投资、贸易、会议、展览、劳务等方面事务所进行的实地考察或洽谈。这类人员进入目的地国时需持商务访问签证。

3、要求不同

港澳通行证内地居民前往香港或澳门特别行政区定居，向户口所在地的市、县公安出入境管理部门提出申请。凭公安出入境管理部门签发的前往港澳通行证前往。

前往香港特别行政区定居的，持证人须于罗湖口岸、深圳湾口岸、蛇口码头口岸（乘船）、福田口岸出境；前往澳门特别行政区定居的，持证人须于珠海拱北口岸出境。

商务签证部分国家移民局要求赴本国考察、访问人员必须身体健康、无刑事犯罪记录，对该国的国家安全不会构成威胁。